Давний спор про УСН и выставление сч-ф с НДС имеет решение.

[Аланда]

lo-lik, я не стала бы выставлять счет-фактуру на полученный аванс,учитывая,что все операции у вас проходят в одном налоговом периоде.Исходя из статьи 173 ,в частности

5. Сумма налога, подлежащая уплате в бюджет, исчисляется следующими лицами в случае выставления ими покупателю счета-фактуры с выделением суммы налога:

1) лицами, не являющимися налогоплательщиками, или налогоплательщиками, освобожденными от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога;

2) налогоплательщиками при реализации товаров (работ, услуг), операции по реализации которых не подлежат налогообложению.

При этом сумма налога, подлежащая уплате в бюджет, определяется как сумма налога, указанная в соответствующем счете-фактуре, переданном покупателю товаров (работ, услуг).

Я это понимаю так,что при отгрузке товара покупателю вы выставляете счет-фактуру на сумму реализации и именно эту сумму указываете декларации и оплачиваете в бюджет.
Поясню свою мысль.По вашему счету-фактуре на аванс покупатель вряд ли будет ставить НДС к вычету,значит,он им не нужен,а вам лишние хлопоты с включением суммы НДС с аванса,потом с восстановлением и снова выставлением счф по отгрузке.Сумма к уплате в бюджет не изменится,она будет ровно такая,какую вы укажете по отгрузке.ИМХО.
Может быть,у кого-то будет другое мнение.