Исчисление НДФЛ индивидуального предпринимателя и входящие платежки без НДС

[max_real]

Индивидуальный предприниматель на ОСН, плательщик НДС, выставляет счета на оплату клиентам с указанием НДС.
Покупатель в платежном поручении не выделяет НДС.
При расчете базы для исчисления НДФЛ ипшник от поступивших на р/с ден.средств отнимает сумму НДС.
Декларация по НДС сдана, налог уплачен.
НИ при проверки выявляет следующее нарушение: т.к. в банковской выписке и входящих платежах не указаны суммы НДС, их (суммы НДС) нельзя использовать для уменьшения базы для исчисления НДФЛ.
Правомерна ли претензия НИ в адрес ИП?