Не выполнили условия контракта

[Fruktik]

Добрый день! Работаем по контрактам. Поставляем продукты питания. К каждому контракту есть спецификация, где указана цена и количество товара. Мы везем партию товара, в накладной и счет-фактуре указываем цену на товары, предусмотренные контрактом. За остатками по контракту следит обычно наш сотрудник и сотрудники Заказчика.
Ситуация следующая. Наш сотрудник не отследил остатки по контракту (Заказчик не вернул подписанные документы) и при следующей поставке наша организация увезла товара больше, чем есть по контракту в остатке.
Прошло 1,5 месяца, продукцию Заказчик благополучно "съел" и оплатил. А сейчас нас выставляют требование об уплате пеней за то, что мы не выполнили условия контракта. Заказчик прав?