Учет НДС по спецификациям

[Ирина Севастополь]

Помогите, пожалуйста. По договору с поставщиком мы на каждую поставку подписываем отдельную спецификацию. В 3 квартале по спец1 мы заплатили аванс за яблоки 1000, по спец2 также заплатили аванс за железо 2000.
В 4 квартале по спец1 получили яблоки на 1500, железо не получали вообще. В результате мы остались должны по спец1 500, а по спец2 – 2000.
Т.к. мы ведем учет по спецификациям, то в 4 квартале в книгу покупок попал НДС от поставки в 1500, а в книге продаж –от аванса в 1000 (все по спец1-за яблоки).
Поставщик ведет учет НДС по договору в целом. При продаже яблок на 1500, он восстановил в книге покупок аванс на 1000 за яблоки и часть аванса за железо на 500.
В своих документах (счетах, упд) поставщик везде указывает спецификации. Мне кажется, что вести учет по спецификациям правильней, ведь для чего-то там указывается номенклатура. Но не могу найти указаний на этот счет.