Не подали вовремя заявление на ЕНВД

[Младший бухгалтер]

Подскажите пожалуйста, такая ситуация: организация зарегистрировалась во 2 квартале 2006года и встала на учет как налогоплательщик УСН (есть уведомление), деятельность начали вести фактически с 3-его квартала. Решили что еще будет и ЕНВД, но бывший бухгалтер не подавал в налоговую заявление о применении ЕНВД, налоги начислял и по ЕНВД и по УСН, КУДИР и форму №1 и форму №2 не сдавал. Я взяла эту фирму недавно начала сдавать все и КУДИР и форму №1 и 2 в налоговую, и тут приходит уведомление, что представленная мною бухотчетность за 1 квартал оставлена без исполнения, т.к. мы находимся на УСН. Что теперь делать, какое пояснение нести в налоговую и ведь там штрафы будут огромные за то что на ЕНВД заявление не подавали. И тут еще выяснилось что со 2 квартала 2009 года они не стали применять УСН, а остались только на ЕНВД (тоже надо было подавать уведомление в налоговую?)