ИП в Вологодской обл., а работа в Московской. Что делать с налогами??

[Ксена]

В бухгалтерии не разбираюсь, поэтому прошу помощи. Такая проблема: ИП зарегистрирован в Вологодской области. Занимается грузоперевозками в Москве и Московской области. Машина (Камаз) оформлена на работу на металлобазу Москвы. За каждую ходку (поездку) база снимает 5% в свой счет (типа оплата логистов) и 18% НДС. Сейчас бухгалтер говорит что нужно заплатить 50000р. Это в казну Вологодской области, получается? Т.е. и база снимает НДС, и город? Или я чего-то не понимаю? Говорят про какой-то ЕНВД. Типа в Вологодской обл. он есть, а в Москве нет..