Уточненка по НДС (убрать из 7 раздела и начислить НДС)

[ВикЧ]

Добрый день, уважаемые формучане!
Как всегда к вам за советом.
У нас все операции без НДС, поэтому я в этом вопросе полный ноль.
Организация в банкротстве. Бывший гл. бухгалтер, когда работала, подала декларацию по НДС за 2 кв. 2015г. В этой декларации в 7 разделе отражена льгота по НДС (реализация лома и отходов черных и цвет. металлов, код операции 1010274).
Налоговая требует либо льготу подтвердить, либо подать уточненку.

Конкурсного управляющего (нас) назначили в 3 квартале. Первички нет, книги продаж нет. Подтвердить льготу мы не можем.
Значит нужно подать уточненку.
И тут возникла масса вопросов.

Скажите, пожалуйста, если операция была освобождена от НДС, а теперь нужно этот НДС начислить, то как быть со сч-фактурой, выставленной покупателю? Его нужно корректировать?
Нужно ли заново формировать книгу продаж? Или достаточно доп. лист? Просто самой книги у нас тоже нет, как это все делать, ума не приложу.