Ведение бухгалтерского учета

[Не важно]

Здравствуйте, очень нужен совет. Я сама работаю бухгалтером, устроилась в новую фирму и образовался довольно важный вопрос. У нас ИП на ЕНВД, занимаемся розничной торговлей, 4 склада по городу. Есть две программы- торговля (где не посредственно отражены все поступления, перемещения, реализации и т.д.) и бухгалтерия. Прежний бухгалтер просто все приходы и расходы на бумажном носителе собирала, складывала и все, получается что база "Бухгалтерия" полностью пустая, в ней только начисление зарплаты и все. Все ведется в "Торговле", но там много не нужных документов, например, сами торговые представители поставляют нам товар, который у них допустим остался, а деньги кладут к себе в карман, соответственно такие документы в бухгалтерии мы провести не можем. Обороты большие, в день минимум 400 документов с одного склада. Вопрос в следующем: как мне лучше вести бухгалтерский учет? Либо оставить все как есть, все документы есть в торговле и все, просто собирать их и подшивать, а бухгалтерию так и оставить с одной зарплатой, но мне кажется это не правильным, ведь если налоговая что нибудь попросит я им показать Торговлю не смогу, там много лишнего, а Бухгалтерия пустая. Либо выгружать все документы в Бухгалтерию, просто удаляя лишнее, но это конечно же колоссальный объем работы. Но это будет правильнее. Налоги мы все платим, ни от чего не уклоняемся. Подскажите пожалуйста как лучше поступить и правильнее, чтоб не попасть под санкции и штрафы.