Муниципальная аренда при ЕНВД

[Оникс]

Наше предприятие осуществляет деятельность только по ЕНВД. Под эти цели мы заключили договор аренды помещения с Комитетом по управлению имуществом. Таким образом мы должны платить двумя отдельными платежками: сумму аренды без НДС в Комитет и НДС 18% как налоговые агенты в бюджет с последующей сдачей декларации в ИФНС.
Одновременно мы заключили договор подряда на капремонт этого арендованного помещения с одной организацией. Есть акт выполненных работ, работу мы оплатили безналом. Ремнотная организация является плательщиком НДС, поэтому мы оплатили сумму ремонта с НДС.
После этого мы написали письмо в Комитет с просьбой зачесть стоимость наших расходов на ремонт в счет уплаты арендной платы сразу за несколько месяцев (стоимость ремонта была большая, она равнялась примерно полугодовой арендной плате). Комитет взаимозачел наши расходы на ремонт без суммы НДС, уплаченной ремонтной организации.

Помогите пожалуйста разобраться в следующем:

1. Я так понимаю, при данной схеме мы потеряли 18% НДС, уплаченных ремонтной организации? (Само собой взять к зачету ни их, ни сумму НДС по аренде мы не можем, т.к. мы не являемся плательщиками НДС).

2. Когда наступают наши обязанности как налогового агента по перечислению НДС в бюджет и сдаче декларации по НДС: согласно договора ежемесячно или в момент, когда произведен взаимозачет?