Договор по списанию долгов м/у бюдж организациями в связи с оказ друг-другу услуг

[glbuhgalter]

Мы бюджетная организация - Главное Управление "А". У нас есть подведомственные организации, бухгалтерии которых ведутся отдельно.
1) В 2008 году пришел новый начальник, который захотел уволить одного из работников подведомственной организации "Б" и написал приказ об его увольнении. Суд этого работника восстановил плюс обязал возместить ущерб в размере 40000 рублей. Деньги ушли с организации "Б". Теперь нас проверяет прокуратура, и говорит, что раз наш приказ, то деньги должны были уйти от нас и мы должны вернуть орг "Б" эти деньги.
2) В этом году по приказу свыше мы оплатили транспортные расходы орг "Б" в размере 60000 рублей.

Можем ли мы теперь не возвращать им эти деньги по суду в размере 40000 рублей, так как мы им оплатили транспортные расходы в размере 60000 рублей, составить договор взаиморасчетов (а если можно, то какой, если есть у кого-то образец, буду очень благодарна), что мы списываем друг-другу долги и претензий не имеем?