Генподрядчик на УСН 15%, субподрядчик на ОСНО

[АннаС]

Схема такая:
1)Субподрядчик выставляет генподрядчику счет-фактуру + КС-2 и КС-3 с НДС, к примеру, работы на 100 руб. (без НДС) ф. КС-2, Кс-3 - 118 руб (с НДС)
Выставил нам с-ф на 118 руб..
2)Наше вознаграждение (услуги генподрядчика 4 %), подрядчик выставляет субподрядчику счет-фактуру на сумму за услуги генподряда + акт. Тут вопрос: мы выставляем субподрядчику на 4 руб (100*4%) или 118*4%
3)Генподрядчик выставляет заказчику счет-фактуру + КС-2 и КС-3 должен был выставить без НДС, но выставили с НДС.
НДС в бюджет не уплатили, а сейчас у заказчика идет налоговая проверка и как я понимаю им могут в вычете отказать.

[DrunkWizard]

У Вас тут ситуация плачевная довольно

Генподрядчик должен был сдать заказчику свои работы 118+4% без НДС.

Другой вариант, генподрядчик мог выставить счет-фактуру с НДС (раньше так можно было), но тогда должен был бы его и начислить, а вот брать в зачет от субподрядчика он его не мог, т.к. на УСН. Т.е. вариант тоже не хороший.

Сейчас, если проверка идет уже, и генподрядчик признает счет-фактуру заказчику, то встревает на НДС и пеню. Если не признает, то может попробовать скинуть вину на заказчика.