начислили НДС

[Entry]

Nikos, вы перепродавец или производитель?
Если перепродаете, то значит все ваши поставщики вам дали СФ без НДС, а следовательно они все применили п. 3 ст. 149 НК РФ.
Значит все ИФНС кроме вашей "ошибаются"?
Тогда так и написать в стиле аргументов вашей инспекции, на протяжении всей деятельности компании от всех поставщиков таких медицинских товаров получены СФ Без НДС. Следовательно, все налогоплательщики также применяют освобождение от налогообложения НДС по п. 3 ст. 149 НК РФ и никаких нареканий в их адрес из ИФНС не поступало.