Заполнение КС-2, КС-3

[MasterKyk]

Уважаемые, нужна ваша помощь и подсказка.

Мы молодая фирма занимающаяся монтажом СКС, бухгалтер он же и ген.директор в одном лице. Мы сделали первый заказ и теперь должны выставить КС-2 и КС-3.
У нас упрощенка - доходы-расходы. НДС нет. Но дабы не потерять заказ мы НДС выставили, к тому же нас уверили что и на упрощенке можно вести НДС.

С КС-3, все понятно, а вот КС-2 вызвало массу споров:
По договору мы прибавили НДС к общей сумме работ и материалов и итого выставили заказчику. Теперь оформляя КС-2 я не могу понять что делать с НДС, в форме нет строчки для НДС, и получается сумма меньше той которая указана в договоре и КС-3. К тому же заказчик взял как структуру договорной цены, наше коммерческое предложение где отдельно прописывалась стоимость работ и стоимость материалов, и потом на все это сверху накидывался НДС 18%.