балансы за 2009-2011 гг. не сходятся с реальным положением дел, так как меняли все

[Gazizov]

Можно последовать совету ГЛБ, и принять входящие остатки своего периода за истину. Но сталкивался не раз с подобной ситуацией на практике. В итоге после налоговой проверки, по инициативе руководителя предприятия либо по итогам аудита (рекомендаций) бухгалтерам все же приходилось приводить все в ажур. Один клиент до сих пор разгребает завалы уже на протяжении 1,5 лет (период с 2004 года). При этом возмещено из бюджета НДСа на приличную сумму, так же скорретированы налоговые базы по прибыли, имуществу за прошлые периоды в положительную сторону.
Как видите есть огромные минусы так и плюсы. В конечном итоге, восстанавливать учет или нет, решать вам и вашему руководству.