НДС при реализации ниже себестоимости

[IrinVB]

Организация на ОСНО, сдает в ареду площади. Один договор заключен по более низкой цене, но по условию договора, арендатор (УСН) за свой счет проведет текущий ремонт крыши, той части помещения, кот. арендует. Налоговая разделила все расходы на только сдаваемые в аренду площади и объявила, что реализация по этому договору ниже себестоимости и предлагает самостоятельно доначислить НДС. Правы ли налоговики?
За ранее огромное спасибо, кто откликнется.