перевыставляют счет-фактуру.

[АнастасияСергеевна]

Вот какой документооборот у нас:
Нам посредник (агент) предоставляет отчет агента, к отчету прикладывает:
копию накладной или акта, высставленного от продавца на имя нащего агента, заверенную агентом;
копию счета-фактуры, высставленного от продавца на имя агента, тоже заверенную агентом;
и счет фактуру, которую высставляет сам агент, при этом продавцом указывает фирму, непосредственно оказавшую услуг, покупателем - нашу организацию, и дополнительно указывает свои данные.
У нас договор заключен только с агентом и платим мы агенту.
В расходы включаем на основании отчета агента, а НДС к вычиту - на основании с/ф от агента.