договор подряда на сотрудника

[Maserati]

ситуация: имеется работник, состоящий в трудовых отношениях с организацией, по профессии менеджер по логистике. Но он программист от Бога, 1С знает изнутри, пишет обработки и создает отчеты необходимые именно нам, с нашей спецификой. Работали с фирмой сопровождающей нас по 1С, и не было ни одного задания, которое он не мог бы сделать сам. В итоге получается, что с экономической точки зрения нам гораздо выгодней заплатить ему, чем той фирме. Вопрос: оформив с ним договор ГПХ, как мне лучше экономически обосновать? Приравнять его работу к часам (с фирмой был договор завязанный на стоимости часа)?
хотя он бы хотел оговаривать не оплату часов, а именно сам факт выполнения работы, т.е. он берется за создание документа/обработки/отчета .... т.п. и говорит, что согласен ее выполнить за такие то деньги...
И еще не будет ли зацепкой для налоговой, то что в штате у нас имеются 2 работника отдела АСУ. в 1С они ... не очень